陰の実力者になりたくて！マスターオブガーデン 散りゆく陰への鎮魂歌

1章

謎の声に導かれ、見知らぬ世界へと飛ばされたアルファたち。そこは千年前の世界だった。

そこで、魔人ディアボロスを封印したと伝わる三英雄――オリヴィエ、フレイヤ、リリ――そしてその仲間七人と合流したアルファたちだったが、圧倒的な力を誇る魔人ディアボロスの攻撃により、シャドウが命を落としてしまう。さらには、主を失った絶望から魔人化したデルタが、圧倒的な魔力で暴走し壊滅状態に。ところが、仲間を失ったアルファが意識を失ったその瞬間、アルファはシャドウが死んだ時点へと戻っていた。

そのようなことが可能なのは『不可逆の懐中時計』と呼ばれるアーティファクトのみ。

一体、誰が何の目的でアーティファクトを操っているのか。

そうしているうちに、デルタの魔人化を回避できたのも束の間、己の力不足に絶望したガンマまでも魔人化し暴走してしまう。

シャドウを取り戻し現代に帰るため、仲間の中に潜んでいる黒幕を暴き出し、シャドウの力を取り込んだ魔人ディアボロスを討伐する過酷な戦いが始まる。

2章

魔人化したガンマが元に戻ることはなく、拠点の牢に幽閉することになる。

また、シャドウの死により自身の理想とする剣の道を見失いかけていたアレクシアは、天才でありながら戦いに無気力なオリヴィエに怒りをぶつけ決闘を挑む。しかし為す術もなく敗れ、己の剣を「最も嫌いな、持たざる者の剣」とオリヴィエに否定されてしまう。

その後、ディアボロスの戦力を削るため、ディアボロスに与する吸血鬼「ゲキツヨン」の拠点を強襲するアルファたち。しかし戦闘の最中、今度はアレクシアとベータが同時に魔人化してしまう。ループの末に、アルファは同士討ちという苦渋の決断で二人を無力化するが、その最中に仲間のひとり・ルージュが崩落に巻き込まれ命を落としてしまう。

ところが、拠点に戻った一行は不可思議な光景を目撃する。なんと、拘束したはずの魔人化ガンマが――正気に戻っていたのであった。

3章

不可解なガンマの回復。相次ぐ魔人化やルージュの死に、未来の世界から来たアルファたちと千年前の英雄たちとの結束は大きく揺らいでいた。そんな中、理想ばかりを語るリリに失望し、自身の内に魔人化の予兆を感じ取ったゼータは、ひとり静かに離脱していく。

さらに拠点では、魔人化し幽閉されていたアレクシアとベータ、そしてそれを見張っていたクレア、ペンテ、ドゥーエたちが忽然と姿を消す事件が発生。一方そのころ、遠征先で自身の過酷な過去と向き合わされたオリヴィエまでもが魔人化の闇に呑まれてしまう。

タイムリープを繰り返すアルファは、彼女を救う望みをイプシロンとリリに託す。イプシロンとリリの決死の説得でなんとかオリヴィエを魔人化から救い出した一行だったが、拠点への帰路、無残に殺害されたイータとノンナ、そして魔人化したゼータの姿を目撃するのだった――

4章

魔人化したゼータによるイータとノンナの殺害。最悪の結末を回避するため、タイムリープしたアルファはふたりを救うべく奔走する。

ゼータの惨劇を未然に防ぐことに成功したアルファだったが、牢から失踪していたクレアが記憶を失った状態で倒れているのが見つかる。

そんな中、拠点内では謎の存在による不可解な事件が起きる。拠点内を調査するアルファとフレイヤだったが、同じく記憶を失ったベータとアレクシア発見。さらに騒動の正体がスライムであると判明する。そして、その背後で糸を引いていたのは魔人化したイータとクレア。ふたりは、事情をよく分かっていないシチーを利用し、魔人化によって赤くなった眼を隠す目薬を使って、「陰の叡智」の復活を企てていた。

次々に増殖していくスライム。

クレアの中に眠る災厄の魔女「アウロラ」の力で事態は沈静化するが、シチーは混乱に乗じて逃亡してしまうのだった。

5章

「血の女王エリザベート」が建国した、吸血鬼と人が共存する国・パキルナに到着したアルファたち一行。しかし、赤き月の影響で始祖エリザベートが暴走し、さらに彼女の魔力に当てられたユキメまでもが魔人化してしまう。さらに、ついに動き出したゲキツヨンの大軍が迫る中、拠点では何者かの襲撃によりフレイヤとローズが殺害されてしまう。直後、幸いにも時間が巻き戻ったため、今度こそ惨劇を防ごうと警戒を強めるアルファたちだったが、今度はデルタとテッセラが殺害されてしまう。そして時間が巻き戻ることはなく、二人の死が確定してしまったのだった。

相次ぐ悲劇とゲキツヨンとの絶望的な戦力差を前に、ただ一人でループの重圧を抱え、疲弊していくアルファ。そんな彼女の負担を少しでも減らし、支えようとベータとイプシロンが立ち上がる。イプシロンは自らを追い込み意図的に魔人化するという決死の作戦で、ゲキツヨンの大軍を相手に絶望的な戦局を覆すのだった。

だがアルファの脳裏には、ある疑念が渦巻いていた。現在、行方が知れないのはゼータだけ。デルタとテッセラを殺害した実行犯は、本当に魔人化したゼータなのか？　森で見た人物は、死んだはずのルージュのように見えたが……？

6章

ゲキツヨンとの決戦後、一連の悲劇に不信感を募らせたノンナはアルファに決闘を挑むが、敗北しひとり陣営を去っていく。一方、アルファの密命でアーティファクトの資料捜索に向かったベータ、リリ、ウィクトーリア（559）は、遠征先で失踪していたペンテやドゥーエと遭遇し交戦するも、その戦いのなかでウィクトーリアが魔人化。シャドウを取り戻すには七陰を傷つけるしかないと思い込み、アルファたちの元へと駆けだしてしまう。リリは、この状況でみなを救えるのは自分だけだと思い、ウィクトーリアを急ぎ追うが、その道中で一度は助けた人間に悪魔扱いをされ、自身の甘さを突きつけられ絶望する。

同じ頃、拠点であるパキルナに残ったローズは、人と吸血鬼が共存するこの美しい街を故郷オリアナと重ね合わせ、すっかり気に入っていた。しかし、国を想うその強すぎる責任感は次第に彼女の精神を蝕み、パキルナを自らの国と思い込むほどに追い詰められていくのだった。

そんな中、遠征先から魔人化したウィクトーリアが戻ってくる。暴走してガンマを殺したウィクトーリアは、パキルナを火の海にしたあと、最後は自害してしまう。遠征先から帰ってきたリリは、目の前の惨状を自分の責任だと感じ、かつてフレイヤが口にした「命には優先順位がある」という言葉の意味を理解する。そして、自分が仲間と対等ではなく、ずっと守られていたということに気づき魔人化。死者をも蘇らせる禁忌の力で、すべてを救済しようとする悲しき聖女へと変貌してしまう。仲間を手に掛けることができずにいたアルファたちの前で、突如としてリリの胸を凶刃が貫く。その剣を振り下ろしたのは、パキルナを自国のオリアナと思い込み、魔人化してしまったローズだった